A fost infiintat ia 16 ianuarie 1990,sub conducerea lui Adrian Mano lache. Acesta s-a retras din conducere la 20 aprilie 1990,cand Conferinţa Naţionala a partidului 1-a ales ca preşedinte pe Otto Weber. PER a participat la alegerile legislative din mai 1990,obţinând 1,69% din voturi pentru Adunarea Deputatilor si 1,38% din voturile pentru Senat,(8 mandate la Camera Deputatilor,unui la Senat).Cele mai multe voturi au fost obtinute in marile orase cu un grad de poluare mai ndicat: Brasov(7,1% din totalul voturilor exprimate),Sibiu(6,37%),Alba Iulia(5,34%),Bacau(4,43%),Bucuresti(2,45%).

La 26 noiembrie 1991 ,PER a participat la fondarea Convenţiei Democrate Romane,alaturi de PNT-CD PNL,PSDR,PAC,UDMR si de formaţiunile civile din

Forumul Democratic Antilotalitar din Romanía (FDAR).Participand pe liste comune cu ceilalţi membri ai alianţei,PER a obtinut,la alegerile din 27 septembrie 1992,patru mandate pentru Camera Deputatilor.

Primul Congres al partidului (25 aprilie 1994) a adoptat Statutul si Programul,a ales conducerea executiva(presedintele Otto Weber) si preşedintele de onoare (Anghel Rugina).

Congresul de la Brasov(8-9 iunie 1996) a adoptat un nou Statut si un nou Program si a ales conducerea:presedmte-Otto Weber,prim-vicepresedinte Cornel

Protopopescu,preşedinte de onoare -Anghei Rugina,vicepresedinti-Mihai Measnicov,Ioan Baras,loan Rosca,Vasile Ghiga,preşedinte al Organizaţiei de Tineret-Claudiu Protopopescu.

La alegerile legislative din 3 noimbrie 1996,PER a paticipat din nou pe listele CDR, obţinând doua mandate de deputat si trei de senator. In august 2000,cand CDR s-a reorganizat PER a ieşit din alianţa, încercând coagularea unui pol ecologist in jurul sau. Acest scop a fost îndeplinit prin crearea Polului Ecogist din Romanía,la 19 septembrie 2000, alaturi de Partidul Alternativa Verde “Ecologistii” si de Convenţia Ecologista din Romania (vezi Polul Ecologist din Romanía).

Polul Ecologist nu a reuşit sa obtina voturile necesare intrării in Parlament,la alegerile legislative din 26 noiembrie 2000,cand a obtinut doar 0,93% din voturile pentru Camera Deputatilor si 0,99% din cele pentru Senat. Acest esec a determinat formarea unui Comitet de initiativa pentru reorganizarea partidului,alcatuit din Cornel Protopopescu,Valentin Vasilescu,Adrian Panzatescu,Claudiu Protopopescu, Anton Creana, Anghei Mihailescu, Vasile Grecu, Gabriela Bosneajoan Nicolae Muresan.In şedinţa din 21 iulie 2001 a Senatului,a fost suspendat întregul Birou Executiv,in frunte cu Otto Weber,si a fost creat un Comitet pentru organizarea unui Congres Extraordinar. Congresul Extraordinar din 1 septembrie 2001 a adoptat un nou Statut ,un Program,si a ales conducerea:Cornel Protopopescu-presedinte,Grecu Vasile – prim-vicepresedinte,Iuliana Dafînoiu-secretar general.De asemenea,Congresul a stabilit strategia partidului pentru urmatoarea perioada,in sensul creării unui singur partid ecologist in Romania,prin fuziunea partidelor existente.In cursul anului 2002, Partidul Ecologist Roman a demarat tratativele de fuziune cu Partidul Alternativa Verde”Ecologistii” si Convenţia Ecologista dm Romania,iar la 1 martie 2003 a avut loc fuziunea acestora,in cadrul unui Congres Extraordinar.Congresul a ales conducerea (Cornel Protopopescu-presedmte,Dan Hazaparu-presedinte al Consiliului National, Marius Mateescu-presedinte executiv,doi prim-vicepresedinti-Mihail Marinescu,Vasile Grecii,secretar general-Octavian Ciobota,15 vicepreşedinţi) si a adoptat un program care are ca obiectiv,pentru alegerile legislative din anul 2004,obţinerea a 8¬10% din voturi,care sa permita articiparea la guvernare.

Congresul Extraordinar al Partidului Ecologist Roman din 5 Iunie 2005 a adoptat un nou Statut, un nou Program Politic si a ales o noua conducere: Petru Lificiu – preşedinte; Octavian Ciobota – preşedinte ai Consiliului National, Marius Mateescu – preşedinte executiv; Viorel Anton – secretar general; Danut Pop – primvicepresedinte, loan Utiu – primvicepresedinte; Vasile Grecu – primvicepresedinte.

In data de 8 Septembrie 2007 cu ocazia întruniri Biroului Executiv Central al Partidului Ecologist Roman domnul Petru Lificiu si-a dat demisia din funcţia de preşedinte al Partidului Ecologist Roman.

In data de 6 Noiembrie 2007 la Consiliul National Extraordinar al Partidului Ecologist Roman se ia act de demisia din funcţia de preşedinte executiv a domnului Marius Mateescu.

Consiliul National Extraordinar al Partidului Ecologist Roman hotareste ca pana la Congresul Extraordinar din primavara anului 2008 conducerea partidului sa fie asigurata de:

• Danut Pop – preşedinte;

• Octavian Ciobota – preşedinte al Consiliului National;

• Vasile Grecu – preşedinte executiv interimar

• Viorel Anton – secretar generai

• Ioan Utiu – primvicepresedinte

Consiliul National Extraordinar al Partidului Ecologist Roman din 6 Noiembrie 2007 a hotarat ca la alegerile locale dinanul 2008 sa participe pe liste proprii.

Congresul din 23.02.2008 a ales in functie de presedinte pe domnul Pop Danut.